Если показатели не совпадают

Предприятие производит муку. Для этого импортируем зерно согласно ПКМ N 429 от 08.07.2021 г., оформляя его в режим ИМ-51 (код контракта 16). После переработки зерна получаем муку и отруби. Муку экспортируем по прямым контрактам (код контракта 17). При импорте зерна и экспорте муки НДС не уплачиваем. Отруби переоформляем в режим ИМ-40 и продаем на внутреннем рынке с НДС. Однако операции, произведенные в течение года, а именно импорт сырья (ИМ-51) и экспорт муки (ЭК-11), не отражаются в расчете НДС в автоматическом режиме из базы данных таможенных органов. В результате данные в отчетности по НДС и налогу на прибыль не совпадают. Что делать предприятию в этом случае?